Hace mucho tiempo, en una isla llamada Altomare, vivían un anciano y una anciana. Un día, la pareja encontró a dos niños pequeños tirados en la orilla, gravemente heridos. Los acogieron y los cuidaron, y los niños se recuperaron rápidamente. Pero entonces, la isla fue atacada por monstruos. En cuestión de segundos, la isla cayó presa de la ira de los monstruos. Pero entonces... Ante los ojos del anciano y la anciana, los niños a los que habían cuidado se transformaron en los Pokémon Eon, Latios y Latias. Llamaron a su familia desde el cielo. Estos llegaron y traían consigo una piedra que contenía el poder para ahuyentar a los monstruos. Esta gema se conocía como el «Soul Dew». La paz volvió a la isla. Sin embargo, más tarde, en el presente, una pareja de criminales —Zannâ y Rion— busca a Latios y Latias para hacerse con el control del Soul Dew. Durante un breve descanso en Altomare, Satoshi se hace amigo de Latias y ahora se ve envuelto en la situación, ayudando a salvar a Altomare de ser engullida de nuevo por la destrucción.
(Fuente: Anime News Network)