La continuación de Yu-Gi-Oh! Zexal.
Ha aparecido un nuevo enemigo: los Barian. Su objetivo es reunir a los «Numbers» y destruir el Mundo Astral para evitar la destrucción de su propio mundo. Por ello, Yuma y sus amigos se convierten en su objetivo principal, y los Barian comienzan a infiltrarse poco a poco en Heartland City.