Ambientada un año antes de la llegada de los Zentraedi a la Tierra, «Macross Zero» narra los últimos días de la guerra entre la U.N. Spacy y las facciones contrarias a la ONU. Tras ser derribado por el nuevo caza de las facciones anti-ONU, el piloto as Shin Kudo se encuentra en la remota isla de Mayan, donde la tecnología es prácticamente inexistente. Mientras Shin permanece en la isla para curarse las heridas, la tranquilidad del lugar se ve alterada por una batalla en la que interviene el nuevo caza de la ONU: el VF-0.
(Fuente: Anime News Network)