Chisa Yukizome comienza su trabajo como profesora titular de la 77.ª promoción de estudiantes de Ultmate de Hope's Peak Academy. Mientras tanto, Hajime Hinata, un estudiante del Curso de Reserva para estudiantes sin talento de la escuela, se prepara para someterse a un experimento para convertirlo en la Última Esperanza. Lo que sigue es una serie de acontecimientos trágicos que conducen al nacimiento de los Restos de la Desesperación y a la realización de "El acontecimiento más grande, más terrible y más trágico de la historia de la humanidad".
Emitido junto con Danganronpa 3: Mirai-hen, con Mirai-hen comenzando primero.