Yu-Gi-Oh! 5D's se desarrolla en Neo Domino City algún tiempo después de los acontecimientos relacionados con Yugi Mutou (DM) y Judai Yuki (GX). Ahora se practica una nueva forma de duelo, los «duelos sobre ruedas», que se disputan en motocicletas llamadas «D-Wheels». Aunque los duelos tradicionales siguen existiendo, los duelos sobre ruedas se han convertido en una forma de entretenimiento muy popular entre los espectadores, que los ven en estadios especialmente diseñados para ello.
