Al sur de Japón, se encuentra una isla verde y exuberante llamada Isla de la Cruz del Sur. Una noche, un niño llamado Takuto Tsunashi aparece en la orilla de la isla. Habiendo nadado desde el continente solo y sin ninguna posesión, se inscribe en el nivel superior de la escuela de la isla: Southern Cross High School.
Con su personalidad brillante y positiva, comienza a relacionarse con varios estudiantes de la escuela y entabla relaciones con muchos de ellos, incluidos Wako Agemaki y Sugata Shindou. Pero esta escuela esconde un profundo secreto. Hay gigantes dormidos escondidos bajo tierra llamados "Cybodies".
Hay alrededor de 20 de estos gigantes, y son solo algunos de los diversos secretos que guardan todos en la isla: Los movimientos secretos de la misteriosa organización conocida como Glittering Crux. Los cantos de las doncellas del santuario. E incluso el propio Takuto pronto descubrirá un gran secreto...
Esta isla de los territorios del sur rodeada por el mar azul y el cielo azul es el escenario donde comenzará el "Elogio de la Juventud" lleno de amor, sueños y amistades.
