Tras mudarse a la tranquila localidad de Hinamizawa, Maebara Keiichi pasa sus días felizmente en el instituto, donde suele jugar con sus amigos del barrio. Sin embargo, las apariencias engañan. Un fatídico día, Keiichi se topa con la noticia de un asesinato que ha tenido lugar en Hinamizawa. A partir de ese momento, se suceden acontecimientos horribles ante los ojos de Keiichi, quien pronto descubre que sus amigos más cercanos quizá no sean lo que parecen. Basada en el juego de misterio amateur de 07th Expansion, la historia se narra a través de una serie de escenarios diferentes.
